{"id":31,"date":"2020-11-16T15:36:56","date_gmt":"2020-11-16T13:36:56","guid":{"rendered":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/?page_id=31"},"modified":"2024-10-06T19:06:36","modified_gmt":"2024-10-06T16:06:36","slug":"maldi-tof-ms","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/etusivu\/maldi-tof-ms\/","title":{"rendered":"MALDI-TOF MS"},"content":{"rendered":"\n<p>MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry) on massaspektrometriaan perustuva menetelm\u00e4 mikrobien tunnistamiseen. MALDI-TOF MS on menetelm\u00e4n\u00e4 mullistanut mikrobiologian laboratorion tutkimusprosessin, koska se on tutkimusmenetelm\u00e4n\u00e4 kustannustehokas, tarkka ja nopea tunnistamaan mikrobiologian laboratoriossa eristettyj\u00e4 bakteereja, sieni\u00e4 ja mykobakteereja.<\/p>\n\n\n<div class=\"wp-block-image\">\n<figure class=\"alignleft size-full is-resized\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"960\" height=\"714\" src=\"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2024\/04\/vitek-ms-prime-mass-spectrometry-system.thumb_.800.480.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-311\" style=\"width:797px;height:auto\" srcset=\"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2024\/04\/vitek-ms-prime-mass-spectrometry-system.thumb_.800.480.jpg 960w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2024\/04\/vitek-ms-prime-mass-spectrometry-system.thumb_.800.480-300x223.jpg 300w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2024\/04\/vitek-ms-prime-mass-spectrometry-system.thumb_.800.480-768x571.jpg 768w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2024\/04\/vitek-ms-prime-mass-spectrometry-system.thumb_.800.480-660x491.jpg 660w\" sizes=\"auto, (max-width: 960px) 100vw, 960px\" \/><\/figure>\n<\/div>\n\n\n<p>Kuvassa BioM\u00e9rieux MALDI-TOF Vitek MS Prime-analysaattori. <\/p>\n\n\n\n<p>Menetelm\u00e4ss\u00e4 on kolme toiminnallista osaa: ionil\u00e4hde, massa-analysaattori ja tunnistamisen suorittava laite. Ionil\u00e4hde ionisoi n\u00e4ytteen ja muuttaa n\u00e4ytteen molekyylien ionit kaasuksi. Massa-analysaattori erittelee ionit niiden massa-varaus-suhteen (m\/z) mukaan, mink\u00e4 j\u00e4lkeen detektori analysoi erottuneet ionit.<\/p>\n\n\n\n<p>Tutkittava n\u00e4yte sekoitetaan n\u00e4ytelevyll\u00e4 matriisiin, jonka teht\u00e4v\u00e4n\u00e4 on auttaa proteiinien ionisoitumista. Matriisi on laitevalmistajan standardoitu valmiste, joka on tarkoitettu k\u00e4ytett\u00e4v\u00e4ksi MALDI-TOF MS -laitteessa laadukkaiden ja luotettavien tulosten saamiseksi. N\u00e4ytteen kiteytymisen j\u00e4lkeen n\u00e4ytelevy asetetaan laitteeseen, jossa levylle asetettuja n\u00e4ytteit\u00e4 s\u00e4detet\u00e4\u00e4n lyhyill\u00e4 laserpulsseilla. Laserpulssin energia saa n\u00e4ytelevyll\u00e4 aikaan desorption ja haihtumisen sek\u00e4 ionisoitumisen kaasufaasiin. Ionisoidut molekyylit kiihdytet\u00e4\u00e4n s\u00e4hk\u00f6kent\u00e4n avulla ja hiukkaset kulkevat vakuumiputken l\u00e4pi detektoriin ionin massasta riippuvalla nopeudella. Pienet ionit kulkeutuvat putkessa nopeasti ja raskaat hitaammin. Ionien lentoaika (TOF, time-of-flight) m\u00e4\u00e4r\u00e4ytyy ionin massan ja varauksen perusteella. <\/p>\n\n\n\n<p>Lopuksi tutkittavat n\u00e4ytteet erotellaan lentoaikojen pituuden perusteella, ja n\u00e4ytteille muodostuvat toisistaan eroavat ja intensiteetilt\u00e4\u00e4n vaihtelevat massaspektrit. Intensiteetti kuvaa detektorille osuneiden ionien m\u00e4\u00e4r\u00e4n tietyn massa-varaus-suhteen kohdalla. Massaspektri on bakteerille yksil\u00f6llinen, joten sit\u00e4 voidaan kutsua bakteerin \u201dmolekyylisormenj\u00e4ljeksi\u201d.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1024\" height=\"199\" src=\"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2021\/11\/Spektriuusyri-1024x199.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-266\" srcset=\"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2021\/11\/Spektriuusyri-1024x199.png 1024w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2021\/11\/Spektriuusyri-300x58.png 300w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2021\/11\/Spektriuusyri-768x149.png 768w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2021\/11\/Spektriuusyri-1536x299.png 1536w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2021\/11\/Spektriuusyri-660x128.png 660w, https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-content\/uploads\/sites\/9214\/2021\/11\/Spektriuusyri.png 1984w\" sizes=\"auto, (max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><figcaption class=\"wp-element-caption\">Kuva 3. Esimerkki bakteerin massaspektrist\u00e4 (Joonas \u00c4iki\u00e4 2021).<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<hr class=\"wp-block-separator has-css-opacity is-style-wide\" \/>\n\n\n\n<p>MURRAY P. 2011. What is new in clinical microbiology \u2013 Microbial identification by MALDI-TOF mass spectrometry. The journal of molecular diagnostics, Vol 14, No. 5, S. 419<\/p>\n\n\n\n<p>CROXATTO, A; PROD\u00b4HOM, G ja GREUB, G. 2011 Applications of MALDI-TOF mass spectrometry in clinical diagnostic microbiology. FEMS microbiology reviews 36. S. 380-382.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry) on massaspektrometriaan perustuva menetelm\u00e4 mikrobien tunnistamiseen. MALDI-TOF MS on menetelm\u00e4n\u00e4 mullistanut mikrobiologian laboratorion tutkimusprosessin, koska se on tutkimusmenetelm\u00e4n\u00e4 kustannustehokas, tarkka ja nopea tunnistamaan mikrobiologian laboratoriossa eristettyj\u00e4 bakteereja, sieni\u00e4 ja mykobakteereja. Kuvassa BioM\u00e9rieux MALDI-TOF Vitek MS Prime-analysaattori. Menetelm\u00e4ss\u00e4 on kolme toiminnallista osaa: ionil\u00e4hde, massa-analysaattori ja\u2026 <span class=\"read-more\"><a href=\"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/etusivu\/maldi-tof-ms\/\">Read More &raquo;<\/a><\/span><\/p>\n","protected":false},"author":2959,"featured_media":0,"parent":57,"menu_order":1,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-31","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/31","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2959"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=31"}],"version-history":[{"count":12,"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/31\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":325,"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/31\/revisions\/325"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/57"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/blogi.savonia.fi\/bakteerienpolku\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=31"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}